Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE4AQ14139 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
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