Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
SHROOM2Q13796 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC31■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
SHROOM2Q13796 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms