Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Length 913 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CUL4BQ13620 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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