Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PKD2Q13563 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PKD2Q13563 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
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