Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SF3B2Q13435 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SF3B2Q13435 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms