Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
XRCC4Q13426 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
XRCC4Q13426 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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