Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SP140Q13342 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SP140Q13342 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SP140Q13342 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
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SP140Q13342 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP140Q13342 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP140Q13342 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SP140Q13342 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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SP140Q13342 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SP140Q13342 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SP140Q13342 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms