Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TRAF3Q13114 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TRAF3Q13114 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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