Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
MRPL28Q13084 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
MRPL28Q13084 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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