Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TRAF1Q13077 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TRAF1Q13077 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
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