Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBRQ0VD83 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBRQ0VD83 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms