Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DDR1Q08345 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DDR1Q08345 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms