Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SOS1Q07889 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SOS1Q07889 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms