Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
POLEQ07864 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
POLEQ07864 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
POLEQ07864 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms