Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CHRNDQ07001 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CHRNDQ07001 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms