Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CALD1Q05682 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CALD1Q05682 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms