Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRB3Q04118 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRB3Q04118 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms