Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GCNT1Q02742 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms