Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
IRF8Q02556 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
IRF8Q02556 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms