Protein–RNA interactions for Protein: Q01970

PLCB3, 1-phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate phosphodiesterase beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLCB3Q01970 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLCB3Q01970 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PLCB3Q01970 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms