Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
BNC1Q01954 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms