Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SPIBQ01892 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SPIBQ01892 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms