Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CACNA1DQ01668 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CACNA1DQ01668 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms