Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
IRF9Q00978 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
IRF9Q00978 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms