Protein–RNA interactions for Protein: P98194

ATP2C1, Calcium-transporting ATPase type 2C member 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2C1P98194 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ATP2C1P98194 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ATP2C1P98194 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms