Protein–RNA interactions for Protein: P98155

VLDLR, Very low-density lipoprotein receptor, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VLDLRP98155 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
VLDLRP98155 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VLDLRP98155 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms