Protein–RNA interactions for Protein: P78411

IRX5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 483 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX5P78411 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
IRX5P78411 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
IRX5P78411 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IRX5P78411 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX5P78411 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.15
IRX5P78411 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
IRX5P78411 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms