Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP1P78357 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP1P78357 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP1P78357 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CNTNAP1P78357 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CNTNAP1P78357 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms