Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SKP1P63208 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SKP1P63208 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SKP1P63208 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms