Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVS71-1P61550 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVS71-1P61550 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms