Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LOXL3P58215 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LOXL3P58215 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms