Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP107P57740 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP107P57740 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NUP107P57740 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NUP107P57740 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms