Protein–RNA interactions for Protein: P56696

KCNQ4, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 4, humanhuman

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ4P56696 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNQ4P56696 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNQ4P56696 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms