Protein–RNA interactions for Protein: P55771

PAX9, Paired box protein Pax-9, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX9P55771 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PAX9P55771 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PAX9P55771 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PAX9P55771 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PAX9P55771 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms