Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
BRPF1P55201 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BRPF1P55201 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms