Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAD23AP54725 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms