Protein–RNA interactions for Protein: P51884

LUM, Lumican, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LUMP51884 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
LUMP51884 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
LUMP51884 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
LUMP51884 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms