Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
TAF6P49848 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
TAF6P49848 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
TAF6P49848 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
TAF6P49848 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms