Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CLK1P49759 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms