Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POU3F4P49335 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms