Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TGM4P49221 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TGM4P49221 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGM4P49221 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGM4P49221 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
TGM4P49221 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TGM4P49221 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms