Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
ATRXP46100 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms