Protein–RNA interactions for Protein: P46094

XCR1, Chemokine XC receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCR1P46094 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
XCR1P46094 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
XCR1P46094 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms