Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LRPPRCP42704 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LRPPRCP42704 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms