Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
USP8P40818 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP8P40818 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP8P40818 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
USP8P40818 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
USP8P40818 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
USP8P40818 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
USP8P40818 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
USP8P40818 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms