Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRIM23P36406 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms