Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DDIT3P35638 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DDIT3P35638 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms