Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HOXD13P35453 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
HOXD13P35453 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
HOXD13P35453 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC21.27■■□□□ 1
HOXD13P35453 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
HOXD13P35453 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms