Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SFTPDP35247 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms