Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ABCD1P33897 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ABCD1P33897 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ABCD1P33897 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ABCD1P33897 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ABCD1P33897 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms